一项前瞻性研究阐明了创新宏基因组工具的作用
发布时间：2023-12-19 10:32:34来源：
科学家们使用下一代测序 (mNGS) 研究了样本的全局遗传特征(或非靶向宏基因组学)在诊断感染中的作用。研究结果发表在《柳叶刀微生物》杂志Lancet Microbe上。
识别与感染相关的微生物感染是确保患者获得最佳治疗的一项重大挑战。最近的流行病表明，能够检测新的或意外的病原体以及基因组快速进化的病原体的工具的重要性。
目前，传染性病原体的搜索主要是“有针对性”的;并且需要事先了解可能的感染原因。然而，在许多情况下，一线检测没有发现任何微生物，感染原因仍然未知，导致治疗效果不佳。
使用下一代测序 (mNGS) 的宏基因组学可以识别多种病原体，包括稀有或新型微生物。这项研究旨在改善这种创新微生物鉴定技术的使用，该技术对于医院实验室来说仍然复杂且昂贵，因为它需要从特定样品制备到大量序列的生物信息学分析等跨学科技能。
医院团队利用巴斯德研究所病原体发现实验室的技术和 IT 技能，致力于在 AP-HP 内以及法国大陆和海外的医疗保健中心的从业人员中提供 mNGS。
在这项研究中，从2019年10月29日至2022年11月7日期间，从523名患者收集了742份样本进行mNGS分析。样本附有由医生填写的强制性处方表，表明临床怀疑感染的程度。
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