抗生素是一种救命工具。然而，由于长期过度使用，微生物不断进化，并产生对抗生素的免疫力。因此，曾经有效的药物不再能预防感染，使治疗变得复杂，亡率增加。

奥尔巴尼大学最近在《自然通讯》杂志上发表的一项研究发现了一种导致抗生素耐药性在致命细菌中传播的新遗传机制。

肺炎克雷伯菌是全球第三大血液感染病原体。这种细菌通常存在于人类的呼吸系统和胃肠道等粘膜表面，一旦有机会入侵，就会引起肺炎和严重的血液和泌尿道感染。这些感染会引发强烈的免疫反应，导致器官衰竭和亡。

“我们知道许多具有重要医学意义的细菌不再对抗生素有反应，有些细菌对多种药物有耐药性，”论文合著者、生物科学系和 RNA 研究所副教授 Cheryl Andam 说。

“在这项研究中，我们与达特茅斯-希区柯克医疗中心的医生合作，通过分析被诊断患有血液感染的患者的细菌基因组序列，试图了解导致肺炎克雷伯菌产生抗生素耐药性的遗传因素。这项研究为我们了解这些细菌如何产生耐药基因并在人群中传播提供了一个窗口。”

这项研究代表了基因组流行病学这一新兴领域，科学家利用全基因组测序跨越时间和空间追踪致病细菌，以了解病原体如何进化和传播。这需要识别群体中单个细菌菌株携带的所有基因和遗传变异。

研究人员分析了达特茅斯-希区柯克医疗中心五年间(2017-2022 年)从成人和儿童血液感染患者身上采集的 136 个肺炎克雷伯菌分离株的基因序列。他们鉴定出 94 个不同的基因序列，表明采样的肺炎克雷伯菌种群具有高度的遗传多样性。