首先，我们需要了解联合培养项目的具体运作方式。通常情况下，联合培养是指两所学校共同制定教学计划，学生在两校之间进行学习。在这种模式下，学生的学籍可能隶属于其中一所学校，而另一所学校则负责部分课程或研究指导。
对于毕业证书的问题，一般而言，学生的毕业证书会由其正式学籍所属的学校颁发。这意味着，如果学生的主要学籍注册在学校A（如西南科技大学），那么即使他们参与了与学校B（如中国科学技术大学）的合作项目，并在B校完成了部分学业，最终的毕业证书仍会以A校的名义发放。
不过，具体情况可能会因各校的具体政策而有所不同。因此，建议有意向参加此类项目的同学提前咨询所在院校的相关部门，获取最准确的信息。
总之，在西南科技大学与中国科学技术大学的联合培养项目中，学生的毕业证书通常会显示为西南科技大学颁发，但具体的细节还需根据实际情况确认。希望这些信息能帮助大家更好地理解这一教育合作形式。
